Почему не рекомендуется изменять прототипы встроенных объектов?

Изменение (монкипатчинг) прототипов встроенных объектов (таких как Array, Object, Function и т.д.) может привести к ряду проблем. Во-первых, это может вызвать конфликт: разные библиотеки или части кода могут определять одноимённые методы, что приведёт к непредвиденному поведению. Во-вторых, новые свойства в прототипах будут перечисляться циклом for...in по всем объектам данного типа, что может нарушить логику существующего кода. В-третьих, некоторые встроенные методы могут полагаться на стандартное поведение прототипов. В целом, изменение глобальных прототипов влияет на всё окружение и усложняет поддержку кода, поэтому лучше избегать этого и расширять функциональность другими способами (утилиты, наследование, композиция и т.п.).